製藥污泥對環境影響也較大
 ，因而有人在進行製藥污泥處理時質疑其是否是危廢 ，製藥行業產生的污泥是否必須由具備危廢處理資質的企業進行處理 。環保企業鄭州鼎盛表示 ，並不是所有的製藥污泥都屬於危廢。

中華人民共和國環境保護部發布的《危險廢棄物鑑定目錄》中明確指出：危廢是具有腐蝕性、毒性、易燃性、反應性或感染性等一衆或幾種危險特性的，不排除具有危險特性，可能對環境或人體健康造成有害影響
，需要按照危險廢物進行管理固體廢物與液態廢物。《鑑定目錄》中也指出，從醫院、醫療中心等產生的廢水處理污泥是危廢來源之一。製藥行業污泥並不全是危廢，因此也不用談其色變，主要根據製藥行業污泥中是否含有被鑑定爲危廢的物質 ，部分製藥行業污泥需到危廢鑑定中心進行鑑定。

目前，製藥行業污泥主要通過深度脫水，對污泥進行固化處理來處置的 。如湖北廣濟藥業 ，先前由於製藥污水污泥的排放被當地環保部門頻頻亮紅燈 ，現今採用鄭州鼎盛高壓污泥壓幹機進行污泥深度脫水
，通過機械壓乾的方式進行製藥污泥處理
，將製藥污泥減量，並對製藥泥餅資源化利用，實現製藥污泥的無害化處理
。

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